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南京農(nóng)業(yè)大學的前身，最早可追溯到1902年的三江師范學校農(nóng)業(yè)自然學部和1914年民營金陵大學農(nóng)業(yè)學部。1952年，全國各大專院校的學院和部門進行了調整，以金陵大學農(nóng)學院、南京大學農(nóng)學院（原國立中央大學農(nóng)學院）為主體，以及浙江大學農(nóng)學院部分系， 并合并成立南京農(nóng)學院。1963年被確定為全國兩所重點農(nóng)業(yè)高等專科學校之一;1971年遷至揚州，與蘇北農(nóng)學院合并，成立江蘇農(nóng)學院;1979年，他搬回南京，修建了南京農(nóng)學院;1984年更名為南京農(nóng)業(yè)大學;2000年由農(nóng)業(yè)部劃歸教育部。

南京農(nóng)業(yè)大學下設農(nóng)學院、工學院、植物保護學院、資源與環(huán)境學院、園藝學院、動物科學技術學院（含無錫水產(chǎn)學院）、獸醫(yī)學院、食品科學技術學院、經(jīng)濟管理學院、公共管理學院等20個學院（系）、 人文與社會發(fā)展學院、生命科學學院、理學院、信息管理學院、外國華語學院、金融學院、草業(yè)學院、馬克思主義學院、人工智能學院、體育系。本科專業(yè)74個，碩士授權一級學科30個，專業(yè)學位授予權21個，博士授權一級學科17個網(wǎng)校頭條，博士后流動站17個;現(xiàn)有全日制本科生18000余人，研究生12000余人。現(xiàn)有教職工2900余人，其中中國工程院院士4人，國家杰出青年科學基金獲得者47人，國家級名師3人，全國優(yōu)秀教師、模范教師、教育系統(tǒng)先進工作者5人，入選其他國家級人才工程和人才計劃150余人， 國家自然科學基金委創(chuàng)新研究組2個，國家級、省級教學團隊7個。

南京農(nóng)業(yè)大學建有“全國大學生文化素質教育基地”、“國家科學基礎科學研究與教學人才培養(yǎng)基地”、“國家生命科技人才培養(yǎng)基地”、“生物科學拔尖人才培養(yǎng)計劃2.0基地”和國家植物生產(chǎn)、動物科學、農(nóng)業(yè)生物學虛擬仿真實驗教學中心。是國內首批通過高等學校本科教學國家級考核的大學之一。2000年經(jīng)教育部批準設立研究生院。2014年入選國家優(yōu)秀農(nóng)林人才培養(yǎng)計劃。農(nóng)學、種子科學與工程、植物保護、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、環(huán)境工程、園藝、園林景觀、茶葉科學、動物科學、水產(chǎn)養(yǎng)殖、農(nóng)林經(jīng)濟管理、國際經(jīng)濟與貿(mào)易、獸醫(yī)學、食品科學與工程、食品質量與安全、生物工程、土地資源管理、行政管理、勞動與社會保障、英語、社會學、農(nóng)村區(qū)域發(fā)展、旅游管理、應用化學、生物科學、生物技術、金融、會計、草業(yè)科學等34個專業(yè)，包括機械設計與制造及其自動化、農(nóng)業(yè)機械化與自動化、農(nóng)業(yè)電氣化、信息管理與信息系統(tǒng)、計算機科學與技術等，已獲批國家一流本科專業(yè)，環(huán)境科學、生態(tài)學、園藝、設施等13個專業(yè)農(nóng)業(yè)科學與工程、中醫(yī)藥、工商管理、市場營銷、電子商務、動物藥學、人文地理與城鄉(xiāng)規(guī)劃、人力資源管理、法學、投資等專業(yè)先后被批準為省級一流本科專業(yè)。在百多年的辦學歷程中，學校堅持以“真誠、樸實、勤勉、仁愛”為核心的南農(nóng)精神，培養(yǎng)了具有“世界眼光、中國情懷、南農(nóng)品質”的拔尖創(chuàng)新型、復合型應用型人才，先后培養(yǎng)了包括院士在內的30萬余名優(yōu)秀人才。

南京農(nóng)業(yè)大學擁有國家一級學科重點學科4個，二級學科國家重點學科3個，國家重點培育學科1個。在第四輪國家一級學科評價中，作物科學、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、植物保護、農(nóng)林經(jīng)濟管理四個學科被評為A+，公共管理、食品科學與工程、園藝三個學科被評為A類。在第五輪國家一級學科考核中，取得了優(yōu)異的成績。有10個學科進入江蘇省高校優(yōu)勢學科建設項目。農(nóng)業(yè)科學、植物學與動物學、環(huán)境生態(tài)學、生物學與生物化學、工程學、微生物學、分子生物學與遺傳學、化學、藥理學與毒理學、普通社會科學、臨床醫(yī)學等11個學科位居世界ESI學科前1%，其中植物學、動物學和農(nóng)業(yè)科學位居世界前1?，位居世界前列。

南京農(nóng)業(yè)大學建有作物遺傳與種質創(chuàng)新利用國家重點實驗室、肉類品質控制與新資源創(chuàng)新國家重點實驗室、肉類品質安全控制國家工程技術研究中心、國家大豆生物育種產(chǎn)教一體化創(chuàng)新平臺、 國家信息農(nóng)業(yè)工程技術中心、國家大豆改良中心、國家有機肥工程技術研究中心、國家地方農(nóng)村土地資源利用與整合聯(lián)合工程研究中心、農(nóng)村土地資源利用與改良國家地方聯(lián)合工程研究中心。國家、部、省級科研平臺114個，包括國家和地方綠色農(nóng)藥創(chuàng)制與應用技術聯(lián)合工程研究中心。“十二五”以來，累計獲得科研經(jīng)費90億元，獲得國家級、部部級、省級科技成果獎200余項，其中國家科技獎12項作為第一完成單位。積極服務國家脫貧攻堅和鄉(xiāng)村振興戰(zhàn)略，憑借雄厚的科研實力南京農(nóng)業(yè)大學是幾本，創(chuàng)造了巨大的經(jīng)濟效益和社會效益，多次被評為“全國科教興農(nóng)先進單位”。先后四次入選教育部直屬高校精準扶貧、扶貧（定向救助）十大典型項目;連續(xù)四年榮獲中央單位指定援助實效考核最高等級——“好”等級。

南京農(nóng)業(yè)大學積極響應國家“一帶一路”倡議，不斷提升國際化水平，與50多個國家和地區(qū)的170多所海外高水平大學和研究機構保持聯(lián)合留學生培養(yǎng)、學術交流和科研合作。美國2019年在新西蘭比利時，經(jīng)教育部批準，教育部與美國密歇根州立大學合作成立南京農(nóng)業(yè)大學聯(lián)合研究院，與密歇根州立大學合作開展“交流訪問”等數(shù)十項長期和短期海外交流項目南京農(nóng)業(yè)大學是幾本， “本科雙學位”和“學士和碩士雙學位”。建立了“中美食品安全與質量聯(lián)合研究中心”、“中肯作物分子生物學'一帶一路'聯(lián)合實驗室”、“動物保健與食品安全國際聯(lián)合實驗室”、“動物消化營養(yǎng)國際聯(lián)合研究中心”、“中英植物表型組學聯(lián)合研究中心”、“南京農(nóng)業(yè)大學-加州大學戴維斯分校全球健康聯(lián)合研究中心”等多個國際合作平臺， “亞洲農(nóng)業(yè)研究中心”等。2007年成為教育部頒發(fā)的“接受中國政府來華留學生獎學金的機構”之一。2008年成為全國首批“助學基地”之一。2012年獲批建設全球首個具有農(nóng)業(yè)特色的孔子學院。2014年，外交部、教育部共同批準成立“中國—東盟教育培訓中心”。2021年12月，牽頭成立“中國-中東歐大學協(xié)會農(nóng)業(yè)與生命科學合作共同體”。2012年，世界農(nóng)業(yè)獎啟動，連續(xù)九年授予來自康奈爾大學、加州大學戴維斯分校、俄亥俄州立大學、波恩大學、阿爾伯塔大學、比利時根特大學、加納大學、智利教皇大學、中國農(nóng)業(yè)大學和默克萊大學的12位獲獎者。

南京農(nóng)業(yè)大學擁有多個校區(qū)一體化發(fā)展，擁有濰崗校區(qū)、濱江校區(qū)、浦口校區(qū)、白馬市教研基地、滁州科教創(chuàng)新園等多個校區(qū)，總占地面積9000余畝。建筑面積74萬平方米，館藏圖書資料235萬冊，外文期刊1萬余種，中文電子書500多萬冊。2014年與自然出版集團共同創(chuàng)辦學術期刊《園藝研究》，2019年入選中國科技期刊“卓越行動計劃”領軍期刊。2018年與Science Publisher共同創(chuàng)辦學術期刊《Plant Phenomics》;2019年，他與Science Publisher共同創(chuàng)辦了學術期刊《BioDesign Research》。

展望未來，作為近代中國高等農(nóng)業(yè)教育的先行者，南京農(nóng)業(yè)大學將以德行修養(yǎng)為立業(yè)之本，以強農(nóng)振興為己任，強化內涵建設，注重改革創(chuàng)新，服務國家戰(zhàn)略需求，著力培養(yǎng)懂農(nóng)、愛農(nóng)的新型人才， 全面開啟建設具有農(nóng)業(yè)特色的世界一流大學新征程！

（資料截至2024年5月）。